Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFRSF25Q93038 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFRSF25Q93038 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TNFRSF25Q93038 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFRSF25Q93038 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFRSF25Q93038 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFRSF25Q93038 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFRSF25Q93038 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFRSF25Q93038 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFRSF25Q93038 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFRSF25Q93038 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFRSF25Q93038 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFRSF25Q93038 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFRSF25Q93038 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFRSF25Q93038 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFRSF25Q93038 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms