Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXQ3

LINC01599, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01599, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01599Q8WXQ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01599Q8WXQ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC01599Q8WXQ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms