Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCG3Q8WXD2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCG3Q8WXD2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms