Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1orf54Q8WWF1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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