Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SKA2Q8WVK7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKA2Q8WVK7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms