Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC7Q8WUI4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC7Q8WUI4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC7Q8WUI4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms