Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC12Q8WUD4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC12Q8WUD4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC12Q8WUD4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms