Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF2Q8TEC5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF2Q8TEC5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF2Q8TEC5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3RF2Q8TEC5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3RF2Q8TEC5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3RF2Q8TEC5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3RF2Q8TEC5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.9 ms