Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRSK1Q8TDC3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRSK1Q8TDC3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms