Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF169Q8NCN4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF169Q8NCN4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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