Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL23Q8NBE8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL23Q8NBE8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL23Q8NBE8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL23Q8NBE8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL23Q8NBE8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms