Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP11CQ8NB49 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP11CQ8NB49 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms