Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD42Q8N9B4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKRD42Q8N9B4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD42Q8N9B4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms