Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q9

NIPA2, Magnesium transporter NIPA2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA2Q8N8Q9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPA2Q8N8Q9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIPA2Q8N8Q9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA2Q8N8Q9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPA2Q8N8Q9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms