Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PAF1Q8N7H5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PAF1Q8N7H5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAF1Q8N7H5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAF1Q8N7H5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAF1Q8N7H5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAF1Q8N7H5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAF1Q8N7H5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PAF1Q8N7H5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms