Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4F7

RNF175, RING finger protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF175Q8N4F7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF175Q8N4F7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF175Q8N4F7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms