Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCL2Q8N4E4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCL2Q8N4E4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms