Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NINQ8N4C6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NINQ8N4C6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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