Protein–RNA interactions for Protein: Q8N468

MFSD4A, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4AQ8N468 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MFSD4AQ8N468 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MFSD4AQ8N468 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MFSD4AQ8N468 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MFSD4AQ8N468 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MFSD4AQ8N468 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MFSD4AQ8N468 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MFSD4AQ8N468 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MFSD4AQ8N468 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.8 ms