Protein–RNA interactions for Protein: Q8N323

NXPE1, NXPE family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE1Q8N323 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NXPE1Q8N323 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXPE1Q8N323 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NXPE1Q8N323 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms