Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00269Q8N2A0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00269Q8N2A0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00269Q8N2A0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00269Q8N2A0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00269Q8N2A0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00269Q8N2A0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00269Q8N2A0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00269Q8N2A0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms