Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCML4Q8N228 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCML4Q8N228 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms