Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC13Q8IYE1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC13Q8IYE1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms