Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NELFCDQ8IXH7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NELFCDQ8IXH7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms