Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FOXP4Q8IVH2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXP4Q8IVH2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXP4Q8IVH2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FOXP4Q8IVH2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXP4Q8IVH2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXP4Q8IVH2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXP4Q8IVH2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
FOXP4Q8IVH2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
FOXP4Q8IVH2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXP4Q8IVH2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXP4Q8IVH2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXP4Q8IVH2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms