Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV48

ERI1, 3'-5' exoribonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI1Q8IV48 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERI1Q8IV48 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERI1Q8IV48 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERI1Q8IV48 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERI1Q8IV48 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERI1Q8IV48 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERI1Q8IV48 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERI1Q8IV48 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERI1Q8IV48 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERI1Q8IV48 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERI1Q8IV48 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERI1Q8IV48 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERI1Q8IV48 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERI1Q8IV48 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERI1Q8IV48 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERI1Q8IV48 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms