Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC71Q8IV32 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC71Q8IV32 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms