Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNL1Q8IU54 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms