Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB11FIP4Q86YS3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RAB11FIP4Q86YS3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms