Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATAD2AQ86YP4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATAD2AQ86YP4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms