Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM50Q86XT4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM50Q86XT4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM50Q86XT4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM50Q86XT4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM50Q86XT4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM50Q86XT4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM50Q86XT4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM50Q86XT4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM50Q86XT4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM50Q86XT4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms