Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00523Q86TU6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00523Q86TU6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms