Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2Q1Q7Z7E8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2Q1Q7Z7E8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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