Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
OTOP1Q7RTM1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
OTOP1Q7RTM1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTOP1Q7RTM1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms