Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARCQ7LC44 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARCQ7LC44 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms