Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1549LQ6ZVL6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIAA1549LQ6ZVL6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms