Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HACD2Q6Y1H2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HACD2Q6Y1H2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD2Q6Y1H2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms