Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSMFQ6X4W1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
NSMFQ6X4W1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NSMFQ6X4W1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NSMFQ6X4W1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224 ms