Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP12Q6UXS9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP12Q6UXS9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms