Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms