Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF05

TTC23L, Tetratricopeptide repeat protein 23-like, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23LQ6PF05 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC23LQ6PF05 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTC23LQ6PF05 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC23LQ6PF05 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms