Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLC3Q6P597 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLC3Q6P597 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms