Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A4Q6P1M0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A4Q6P1M0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A4Q6P1M0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A4Q6P1M0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A4Q6P1M0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC27A4Q6P1M0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A4Q6P1M0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms