Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CAVIN1Q6NZI2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAVIN1Q6NZI2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAVIN1Q6NZI2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms