Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDE2Q6IQ49 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDE2Q6IQ49 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms