Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCAPH2Q6IBW4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NCAPH2Q6IBW4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms