Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SFRP4Q6FHJ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP4Q6FHJ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP4Q6FHJ7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms