Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF43Q68DV7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF43Q68DV7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF43Q68DV7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF43Q68DV7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF43Q68DV7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF43Q68DV7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF43Q68DV7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF43Q68DV7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF43Q68DV7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF43Q68DV7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF43Q68DV7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF43Q68DV7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF43Q68DV7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF43Q68DV7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF43Q68DV7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms