Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SLX4IPQ5VYV7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLX4IPQ5VYV7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms