Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF3Q5VWG9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF3Q5VWG9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms